Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BPIFA3Q9BQP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BPIFA3Q9BQP9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BPIFA3Q9BQP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms