Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPIN3Q9BQK8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms