Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN18Q99952 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN18Q99952 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms