Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELF4Q99607 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELF4Q99607 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELF4Q99607 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms