Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF12Q99081 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF12Q99081 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF12Q99081 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms