Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDRT15Q96T59 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms