Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRAMP1Q96RY5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CRAMP1Q96RY5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRAMP1Q96RY5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRAMP1Q96RY5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms