Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CICQ96RK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CICQ96RK0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CICQ96RK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms