Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATA13Q96N96 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA13Q96N96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms