Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARK4Q96L34 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARK4Q96L34 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARK4Q96L34 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARK4Q96L34 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARK4Q96L34 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARK4Q96L34 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARK4Q96L34 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARK4Q96L34 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms