Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PRAC1Q96KF2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms