Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87BQ96K49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM87BQ96K49 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM87BQ96K49 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms