Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC41A2Q96JW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC41A2Q96JW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC41A2Q96JW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms