Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
BCANQ96GW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
BCANQ96GW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
BCANQ96GW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms