Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BORCS6Q96GS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BORCS6Q96GS4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BORCS6Q96GS4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms