Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUB1Q96FW1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUB1Q96FW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms