Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIPA1Q96FS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIPA1Q96FS4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIPA1Q96FS4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms