Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23CQ96ET8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms