Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C18orf8Q96DM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C18orf8Q96DM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C18orf8Q96DM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms