Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUB2Q96DC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB2Q96DC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms