Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW6

SLC7A6OS, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A6OSQ96CW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A6OSQ96CW6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A6OSQ96CW6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms