Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TP53INP1Q96A56 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53INP1Q96A56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms