Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC102AQ96A19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC102AQ96A19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC102AQ96A19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms