Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEO1Q92859 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEO1Q92859 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms