Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL1Q8WXF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms