Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS9Q8WXC6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPS9Q8WXC6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms