Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBR1Q8WVP7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMBR1Q8WVP7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMBR1Q8WVP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms