Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
TRIM41Q8WV44 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRIM41Q8WV44 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM41Q8WV44 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM41Q8WV44 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.5 ms