Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SFT2D1Q8WV19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms