Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TSKUQ8WUA8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms