Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIN3Q8TB24 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIN3Q8TB24 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms