Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM58Q8NG06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM58Q8NG06 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms