Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT1Q8NF37 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT1Q8NF37 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LPCAT1Q8NF37 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms