Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM46DQ8NEK8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM46DQ8NEK8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM46DQ8NEK8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms