Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms