Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC84Q86UT8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC84Q86UT8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC84Q86UT8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms