Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPAINQ86UA6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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