Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00523Q86TU6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00523Q86TU6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms