Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COPS6Q7L5N1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COPS6Q7L5N1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COPS6Q7L5N1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms