Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KNDC1Q76NI1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KNDC1Q76NI1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KNDC1Q76NI1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
KNDC1Q76NI1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KNDC1Q76NI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KNDC1Q76NI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KNDC1Q76NI1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms