Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP50Q70EL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP50Q70EL3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP50Q70EL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP50Q70EL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms