Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VITQ6UXI7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VITQ6UXI7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VITQ6UXI7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms