Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPE4Q6UWF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPE4Q6UWF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPE4Q6UWF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms