Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BLOC1S2Q6QNY1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BLOC1S2Q6QNY1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BLOC1S2Q6QNY1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms