Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM88Q6PEY1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM88Q6PEY1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms