Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAVIN1Q6NZI2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN1Q6NZI2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms