Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE12Q6L8Q7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE12Q6L8Q7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE12Q6L8Q7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms