Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSAPQ6IQ19 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSAPQ6IQ19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms