Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLFN12LQ6IEE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLFN12LQ6IEE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12LQ6IEE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms