Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RALGAPA1Q6GYQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RALGAPA1Q6GYQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms